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稻瘟病菌单加氧酶lpmo M1基因的克隆及生物信息学分析

         

摘要

多糖裂解单加氧酶(LPMO)是一类新型的可以与水解酶系协同降解纤维素、几丁质和淀粉等难溶多糖的酶.以稻瘟病菌(Magnaporthe grisea 70-15)为研究对象,采用逆转录-聚合酶链反应克隆得到多糖裂解单加氧酶基因lpmo M1,成功构建了真核表达载体pPICZαA-lpmo M1.生物信息学分析表明该基因编码区长819 bp,编码272个氨基酸,预测该基因的理论分子质量为28.85ku,等电点为7.66;结构预测显示存在7个O-糖基化位点和16个磷酸化位点,没有N-糖基化位点.通过生物软件Vector NTI对不同来源的LPMO的同源性进行分析,结果显示稻瘟病菌LMO M1与其他LPMO同源性最高仅为41%;系统进化分析发现稻瘟病菌(Magnaporthe grisea 70-15)的多糖裂解单加氧酶LPMOM1与黄孢原毛平革菌(Phanerochaete chrysosporium)的同类酶Gh61D亲缘关系最近.

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