基于生物信息学分析CDK1在肝细胞癌中的表达及其意义

摘要

目的研究生物信息学分析CDK1在肝细胞癌中的表达,为探讨CDK1在肝细胞癌发病机制及预后中的作用提供依据。方法通过TCGA GDC官网下栽实验及临床数据,将数据整理,利用R语言limma包进行处理并筛选差异基因,将分析得到的差异基因表达量和患者生存时间、生存状态整合的矩阵用COX回归模型作生存分析,寻找对肝癌预后产生影响的独立危险因子,通过R语言进行GO和KEGG分析,利用Java进行GSEA分析。结果CDK1差异基因散点图做出肝癌与正常组的配对分析,差异有统计学意义(P0.05发现逻辑回归有意义进行单因素、多因素COX分析发现CDK1可以作为肝癌的独立预后因子。结论CDK1参与了肝细胞癌(HCC)发病机制,可以作为判断肝癌的独立预后因子。