基于生物信息学分析CISD2在肝细胞癌中的表达意义及功能网络关系

摘要

目的 探究CDGSH铁硫结构域2(CISD2)在肝细胞癌(HCC)发生发展中的作用、临床病理意义及其潜在作用机制.方法 Kaplan Meier-plotter分析CISD2 mRNA表达与HCC患者5年生存率的关系;在线网页工具STRING构建CISD2蛋白相互作用网络,基因本体论富集分析CISD2蛋白质功能;网页工具TIMER分析CISD2在HCC中与免疫细胞浸润含量之间的关系;GSEA分析CISD2高表达在HCC中参与的信号通路.结果 (1)CISD2mRNA高表达的HCC患者的5年总生存率低于低表达患者;(2) CISD2与B细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞、巨噬细胞和树突状细胞的浸润呈负相关;(3) CISD2主要参与了细胞内二价铁硫簇结合,铁硫簇绑定以及金属集群绑定;(4) GSEA分析表明CISD2高表达在HCC中促进卟啉和叶绿素代谢,戊糖、葡萄糖醛酸转换,抗坏血酸和醛酸代谢,氨基糖和核苷酸糖代谢,淀粉和蔗糖代谢等多条代谢通路.结论 (1)在HCC中,CISD2 mRNA高表达与HCC患者的较差预后有关.(2) CISD2可能通过影响肿瘤细胞的铁离子、能量代谢和肿瘤免疫微环境促进肿瘤细胞的生存和增殖.