肝细胞癌中差异表达EST的生物信息学分析和功能预测

摘要

目的采用生物信息学方法分析、预测在原发性肝细胞癌中差异表达表达序列标签(expression sequence tag,EST)的全长、ORF、电子表达谱、染色体定位和编码蛋白质的功能,指导实验研究.方法应用多种生物学软件进行分析.结果获得两条新基因的全长序列,和RACE方法、测序获得的结果一致;两条EST分别定位于2p13～15、3p14;高表达EST主要表达于肿瘤组织,低表达EST主要表达于正常组织;高表达基因所编码蛋白质参与细胞信号转导、前mRNA加工和细胞骨架组装,低表达编码蛋白质和机体T淋巴细胞介导的免疫反应有关.结论采用生物信息学技术有助于高效、快速地克隆、鉴定新基因.