miRNA在沙田柚配子体自交不亲和反应中的差异表达与功能分析

摘要

以沙田柚自交1~3 d以及异交1~3 d花柱为实验材料,构建小RNA测序文库。利用HiSeq深度测序对Small RNA进行测序,然后对差异表达miRNA进行分类注释和靶基因预测,并对靶基因进行GO功能注释以及KEGG pathway注释。结果表明自交1~3 d花柱中已知miRNA的个数分别为178、179和186个,而新miRNA分别为640、739和801个。异交1~3 d花柱中的已知miRNA的个数分别为232、122和219个,新miRNA分别为1184、476和836个。在YJ1/ZJ1、YJ2/ZJ2、YJ3/ZJ3的比对中共获得了16个差异表达的已知miRNA以及23个差异表达的新miRNA。差异表达miRNA靶基因的GO功能显著性富集分析结果表明,这些miRNA靶基因的功能涉及到RNA降解、转录因子、植物激素、植物与病原菌相互作用、结合功能、激酶等代谢过程。通过本研究,挖掘出了一些与沙田柚自交不亲和相关的miRNA,可为今后阐明沙田柚配子体自交不亲和的分子机理提供依据。