牡丹WD40类转录因子基因PsWD40-1和PsWD40-2的分离与序列分析

摘要

利用已构建的牡丹‘洛阳红’花瓣转录组数据库,筛选得到2个与植物花青素苷合成WD40蛋白同源性较高的Unigene序列,分别命名为PsWD40-1和PsWD40-2.利用RT-PCR技术,设计特异性引物对PsWD40-1和PsWD40-2最大阅读框(ORF)序列进行扩增,测序结果表明PsWD40-1序列包含一个1 035bp的ORF,编码一个344 aa的肽链;PsWD40-2序列包含一个1 032 bp的ORF,编码一个343aa的肽链.牡丹PsWD40-1.和PsWD40-2基因推测所编码蛋白序列均具有典型的WD40结构域.PsWD40-1蛋白序列与葡萄VvWDR2相似性为96％,PsWD40-2蛋白序列与葡萄VvWDR1相似性为87％.系统进化树分析发现,PsWD40-1与葡萄VvWDR2、拟南芥AtAN 11、陆地棉GhTTG2等序列聚在MP1分支,而PsWD40-2与葡萄VvWDR1、矮牵牛PhAN11、紫苏PfWD40等序列聚在另一分支TTG1/PAC1分支.