枸杞LbAPX基因cDNA片段的克隆及生物信息学分析

摘要

本实验通过TRIZOL法提取了"宁杞1号"花药总RNA,采用SMART PCRcDNA Synthesis Kit试剂盒合成cDNA,根据先前质谱鉴定的肽段序列搜索数据库中与之相似保守序列设计引物,利用RT-PCR技术克隆了枸杞Lb APX基因的cDNA片段,并进行生物信息学分析。结果表明,LbAPX基因cDNA片段共长671 bp,其中的ORF长为456 bp,编码146个氨基酸。经cDNA编码产物的同源性和系统发生分析表明,枸杞LbAPX基因属于APX超基因家族,其氨基酸的序列与马铃薯的同源性高达96%。