基于RNA-seq分析人肝癌耐药细胞BEL-7402/FU的差异表达基因

摘要

目的 分析调控人肝癌耐药细胞BEL-7402/FU耐药的关键基因和信号通路,进而探讨引起肝癌多药耐药的可能机制,寻找逆转肝癌多药耐药的潜在靶点.方法 TRIzol法提取人肝癌细胞BEL-7402与耐药细胞BEL-7402/FU的总RNA,采用RNA-seq测序技术检测两组细胞的数字基因表达谱并筛选差异表达基因(DEGs),运用生物信息学分析方法对DEGs进行生物通路等富集分析.结果 检测到上调的DEGs数为2 899个,下调的DEGs数为3 313个;GO富集及KEGG分析发现涉及的主要生物进程为单生物体过程类别、细胞类别、结合分子功能类别,主要的信号通路为代谢通路等;PPI分析显示,在蛋白互作网络中具有重要作用的基因为TP53、EGFR、MAPK8、BCL2L1、STAT5A、STAT5B、ABALON、FYN、CDKN1A、BCL2等.结论 肝癌耐药过程涉及到多个基因和通路,这些具有差异的基因和通路或将成为逆转肝癌耐药的靶点.