基于Cyt b基因探讨羚羊亚科原羚属系统发生关系

摘要

原羚属物种在羚羊亚科中的分类地位尚存在很多争议.本文测定了原羚属的黄羊和藏原羚细胞色素b基因全序列(1 140 bp),并与牛科其它属31个种的同源序列进行比较,对其碱基组成变异情况及核苷酸序列差异进行了分析.基于细胞色素b基因全序列,用简约法(MP)、邻接法(NJ)和似然法(ML)构建了系统进化树.结果表明:黄羊和藏原羚的序列差异为3.78%,颠换数目近乎为0,其突变远未饱和;原羚属内黄羊和藏原羚为不同种,单系发生;原羚属与赛加羚羊属、犬羚属及跳羚属等并系发生,原羚属隶属于羚羊亚科,应为独立属;羚羊亚科组成属间多为并系起源.根据序列差异值2%/百万年的细胞色素b分子钟,推测黄羊和藏原羚分歧时间大约为1～2百万年;原羚属与羚羊亚科其它属分歧时间大约在5.7～8百万年.