原羚属及羚羊亚科属间系统发育关系研究

摘要

该文对3个四川藏原羚(Procapra picticaudata)、2个斑羚(Capricornis crispus)和5个鬣羚(Nemorhaedus caudatus),以及3个内蒙古黄羊(Procapra gutturosa)进行了细胞色素b基因全序列(1140bp)测定.利用这些测序结果,并结合从Genebank获取的牛科其它31个种,进行了同源比较,以分析它们碱基组成变异情况及核苷酸序列差异.用简约法(MP)邻近法(NJ)和似然法(ML)构建分子系统树.结果表明:1.黄羊和藏原羚的序列差异为3.78%,颠换数目近乎为0,其突变远未饱和;原羚属属内黄羊和藏原羚为同属不同种,单系发生;根据序列差异值2%/百万年的细胞色素b分子钟,推测黄羊和藏原羚分歧时间大约为1~2百万年.2.原羚属与羚羊亚科赛加羚羊属、犬羚属及跳羚属等并系发生,起源于共同祖先、为羚羊亚科下的姊妹群.原羚属为羚羊亚科独立属;羚羊亚科组成属间除印度羚属和羚羊属(仅NJ、ML树)单系起源外,其余为并系起源.根据序列差异值2%/百万年的细胞色素b分子钟,原羚属与赛加羚羊属的分歧时间大约在5.7~6.3百万年之间、与犬羚属的分歧时间大约在6.1~7.2百万年之间、与羚羊属的分歧时间大约在6.4~7.1百万年之间、与跳羚属的分歧时间大约在6.2~6.8百万年之间.此外,原羚属与亲缘关系较远的岛羚属、藏羚属和山羚属之间的分歧时间大约在7~8百万年.

目录

致谢

摘要

ABSTRACT

第一部分前言

1.原羚属物种的生物学研究概况

1.1生态学研究

1.2生理生化及分子生物学研究

1.3系统学研究

2.研究目的和意义

第二部分材料与方法

1.材料

1.1样品

1.2试剂

1.3主要的仪器设备

2.方法

2.1 DNA提取

2.2 PCR 扩增

2.3 DNA克隆

2.4测序

2.5 DNA序列数据处理分析

第三部分结果和讨论

1.细胞色素b基因碱基序列组成、变异位点及序列差异

2.细胞色素b基因序列核酸变异方式

3.细胞色素b基因转换颠换散点饱和性分析

4.细胞色素b基因全序列分子系统树构建

5.讨论

5.1黄羊与藏原羚系统发育关系

5.2原羚属系统发育关系

第四部分结论与展望

参考文献

在读期间撰写和发表的学术论文

附录：安徽铜陵淡水豚自然保护区淡水豚受胁迫因素及保护对策探讨