基于RNA-Seq分析茶树新品系‘春绿’生物信息

摘要

【目的】为加深对茶树新品系‘春绿’分子机制及优异性状的遗传基础的了解。【方法】以茶树品种(系)‘福云6号’和春绿叶片为材料,利用第二代测序技术,构建基因转录本。【结果】获得新品系春绿的Clean reads达到47.37 M,比对照福云6号少0.76 M;共拼装成41159条unigenes,其中31706条unigenes能被GO数据库成功注释,分别涉及到3651个GO组。差异显著基因有7042条,分别为23个生物学过程的GO组、20个细胞成分的GO组及21个基于分子功能的GO组。KEGG富集分析发现,有8657个基因注释到191个代谢通路中,这些基因中有1277个显著差异基因。66条DEGs参与苯丙素的生物合成(ko00940),3条DEGs参与谷胱甘肽代谢(ko00480),40条DEGs参与卵母细胞减数分裂(ko04114),45条DEGs参与RNA降解(ko03018),14条DEGs参与角质、亚伯碱和蜡的生物合成(ko00073)。【结论】转录组测序分析结果阐明了春绿新品系生长发育的部分分子信息,对利用其进一步开展分子辅助育种等具有较为重要的意义。