cpcHID操纵子序列用于钝顶节旋藻品系分类与鉴定的研究

摘要

克隆并测定7株钝顶节旋藻品系的cpcHID操纵子序列,以及16S rRNA和16S-23S rRNA转录单元内间隔区(ITS)序列,进一步通过生物信息学和分子系统学等研究发现:(1) 7株品系的cpcHID序列,以及16S rRNA和ITS序列具有很高的相似性.(2) 基于7株品系cpcHID序列的GC含量绝对偏差平均值、碱基变异率和遗传距离系数普遍比基于16S rRNA和ITS序列的大.(3) 基于cpcHID序列的分类结果与基于16S rRNA和ITS序列的十分相近.因此,cpcHID可作为节旋藻等蓝细菌分类与鉴定的一种新的分子标记,特别是以其丰富的信息量而在品系水平的分类鉴定中占有优势.