广州地区嗜肺军团菌环境分离株的基因序列分型分析

摘要

[目的]研究广州市嗜肺军团菌的基因特征,对来自不同水域环境的嗜肺军团菌进行分子分型研究.[方法]选择嗜肺军团菌的7个基因flaA、asd、mip、pilE、mompS、proA和neuA作为目的基因,对在2006-2009年间广州地区分离的44株嗜肺军团菌进行PCR扩增和测序,并将核苷酸序列上传至欧洲军团菌病感染工作组(EWGLI)数据库进行比对,得到基因型别(Sequence type,ST),对结果进行基因序列分型(Sequence-Based Typing,SBT)和系统进化分析.[结果]44株嗜肺军团菌可分为20个ST型,ST01占30%(13/44),与数据库比对得到15个新ST型,截至发稿,其中2个新ST型获EWGLI分配序号(ST887和ST888).通过BURST和SplitsTree建立的系统发育树得到本地区嗜肺军团菌的遗传关系.[结论]广州市嗜肺军团菌的群体基因型具有地区特异性和遗传多样性,SBT方法对于研究嗜肺军团菌的基因差异与流行病学具有重要意义.