SNPs及其在水产动物遗传学与育种学研究中的应用

摘要

@@ 1 SNP简介rn1.1 SNP的概念rn单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)指基因组DNA序列中某个特定位点的单个核苷酸发生变异而引起的序列多态性,包括单碱基的转换、颠换、插入及缺失等形式,其中一种等位基因在群体中的频率不小于1%[1].在SNP的碱基突变类型中,颠换较少,转换较多(约占2/3).并且SNP的转换变异以C←→T为主,可能是因为CpG二核苷酸上的胞嘧啶残基大多数是甲基化的,可自发地脱去氨基而形成胸腺嘧啶,CpG也因此变为突变热点[2].理论上SNPs可能是二、三、四等位基因多态的,但三或四等位基因的SNPs几乎不存在,因此SNPs也被称为二等位基因(或二态)遗传标记[3].