水稻snoRNA47基因簇的初步鉴定

摘要

通过生物信息学分析, 在水稻染色体中发现一个新的C/D框snoRNA 基因簇. 此基因簇含有3个C/D框snoRNA基因, 它们都具有典型的C框和D框保守元件; 末端能形成茎环结构; 含有一段相同的12 nt"引导"序列, 此序列能与水稻18 S rRNA中第621位到632位的序列互补配对. 通过实验证明, 这3种snoRNA 的确存在于水稻细胞核内, 并确定出它们各自5′端的位置. 进一步对此snoRNA基因簇的表达进行研究发现, 此基因簇中的3个snoRNA基因共同转录成为一个多顺反子的前体. 将这3种新发现的水稻snoRNA分别命名为OSsnR47.1, OSsnR47.2和OSsnR47.3. 编码它们的基因已被GenBank收录, 其登录号分别为: AF453504, AF453503和AF453502.