甘蓝型油菜角果长度性状的全基因组关联分析

摘要

角果长度是油菜重要的农艺性状,适度增加角果长度有利于扩大角果库容量,增加光合面积,提高油菜的籽粒产量.本研究利用Illumina 60K SNP芯片对496份具有代表性的油菜资源进行基因型分析,考察群体在4个环境中的角果长度表型,利用MLM和GLM模型进行全基因组关联分析.结果表明,MLM模型检测到7个位点,联合解释25.01％的表型变异;GLM模型检测到25个位点,联合解释41.77％的表型变异.合并共同位点后得到27个位点,其中7个与前人报道的QTL重叠,其余20个是新鉴定的位点.效应最大的位点Bn-A09-p29991443位于A09染色体,在MLM和GLM模型中分别解释13.89％和12.86％的表型变异,携带其优异等位基因的材料平均角果长度增加0.89 cm.同时,在该位点附近找到已克隆的油菜角果长度基因ARF18和BnaA9.CYP78A9.此外,在5个位点附近发现拟南芥已知角果长度基因GID1b、FUL、EOD3、DOF4.4和GA20ox1的同源拷贝.本研究结果有助于解析角果长度的遗传基础,为研究角果长度的调控机理,指导角果长度的遗传改良打下基础.