玉米光周期敏感类Hd6基因的克隆和实时定量表达分析

摘要

水稻Hd6基因在调节水稻光周期敏感中起重要作用.本研究以热带玉米自交系CML288为材料.利用同源基因克隆法结合3′RACE技术克隆了与水稻Hd6基因同源的玉米类Hd6基因.该基因序列中999 bp的开放阅读框可编码332个氨基酸.BLAST分析发现,该基因与玉米中编码蛋白激酶CK2的一个基因高度同源,所推测的氨基酸序列包含2个CK2活性区域,1个N末端区域,1个ATP结合位点和1个丝氨酸,苏氨酸蛋白质激酶活性位点,与玉米、小麦、水稻和拟南芥的CK2氨基酸序列也有较高的同源性.建立了SYBR GREEN法实时荧光定量RT-PCR表达分析系统,研究了不同光周期处理下类Hd6基因在光周期敏感自交系CML288茎尖和叶片中的表达.结果发现,该基因在茎尖和叶片中均有表达.在短日条件下,该基因在6～8叶期茎尖中的表达量存在明显差异,在光周期敏感的7叶期出现表达高峰,在叶片中的表达量均低于茎尖.在长日条件下,该基因在茎尖中6叶期表达量较低,在光周期敏感的9叶期在叶片中高量表达.由此可推测,该基因与玉米光周期敏感密切相关,可能在光周期敏感调节过程中发挥一定的作用.