肾型鸡传染性支气管炎病毒DQ株S1基因结构分析

摘要

选用Trizol试剂抽提肾型鸡传染性支气管炎病毒(IBV)DQ株基因组RNA,采用特异性引物通过RT-PCR扩增其S1基因cDNA,克隆入pBluescript质粒载体中,作测序分析.结果表明,DQ株S1基因全长为1 731 nt ,编码一条576个氨基酸组成的多肽,其核苷酸与IBV-4/91,Gray,D41,Beijing,ZJ971,Beaudette,H120,M41毒株的同源性为78.4%～82.73%,氨基酸同源性为74.41%～78.96%.DQ株不同于其它血清型IBV的主要特征为:在S1基因核苷酸序列上,第278-299位之间插入了一段新的序列,第423-431位碱基缺失,有许多点突变;二级结构上表现为第2-22位氨基酸区域、第92-98位氨基酸区域亲水性增强,第74-76位氨基酸区域疏水性增强,最大亲水峰改变.S1分子进化系统分析显示,DQ株与其它各毒株的亲缘关系较远.