基于高通量测序技术研究云南玉米根际微生物群落多样性

摘要

研究不同海拔高度和玉米品种类型对玉米根际微生物多样性的影响,利用Illumina Miseq高通量测序对云南不同海拔和品种类型的玉米根际细菌和真菌多样性进行分析.玉米根际细菌和真菌OTU数量和Chao1指数随海拔升高而增加,且饲料玉米高于鲜食玉米,不同海拔和品种类型的玉米根际微生物多样性差异明显.玉米根际细菌的优势菌群为变形菌门、拟杆菌门和放线菌门,鞘氨醇单胞菌属(5.91％)和芽孢杆菌属(8.88％)为玉米根际的优势属,但高海拔地区的玉米根际特异检测到芽单胞菌属(4.34％);水恒杆菌属(6.10％)为鲜食玉米的优势属;玉米根际真菌的优势菌群为子囊菌门、担子菌门和接合菌门,被孢霉(7.42％)、镰孢霉属(10.88％)和青霉菌属(4.03％)是优势属.海拔高度和品种类型是影响玉米根际微生物群落多样性的重要因子.