高通量测序分析羊肚菌——赤松茸轮作土壤微生物群落结构变化

摘要

基于高通量测序平台Illumina Novaseq剖析了羊肚菌—赤松茸轮作土壤微生物的变化,探究了轮作赤松茸对羊肚菌土壤微生物群落结构和多样性的影响。结果表明:(1)轮作赤松茸后,土壤细菌、真菌群落的Simpson和Shannon指数显著提高;土壤微生物群落组成变化不显著,但其相对丰度存在显著差异。(2)ydj0、ydj1和csr1的优势细菌门均为Proteobacteria,优势真菌门均为Ascomycota;但3种土样优势属细菌分别为Pseudomonas、Sphingomonas和隶属于Gemmatimonadaceae的细菌属。(3)csr1土壤中Bacteroidota、Chitinophagaceae和Chaetomium的相对丰度较ydj1土壤的显著增加;而Myxococcota、Gemmatimonas、Basidiomycota和Tausonia相对丰度较ydj1土壤的显著降低;大多数细菌类群在csr1与ydj1土壤中相对丰度变化趋势相反。综上所述,羊肚菌—赤松茸轮作可以提高羊肚菌土壤微生物群落的物种多样性,有效调节羊肚菌土壤微生物菌群结构的平衡关系,栽培赤松茸对羊肚菌栽培土壤有一定的修复作用,但修复机制还有待进一步研究。