诺如病毒基因组序列分析及诺如病毒GI基因型特异性检测体系设计

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第一章 绪论

1.1 诺如病毒概述

1.1.1 诺如病毒的结构

1.1.2 诺如病毒基因组结构特征

1.2 诺如病毒基因分型

1.3 诺如病毒的流行病学特征

1.4 诺如病毒检测方法的研究进展

1.4.1 电子显微镜观察

1.4.2 免疫学方法

1.4.3 分子生物学方法

1.5 研究目的与意义

1.6 主要研究内容

第二章 诺如病毒基因组序列分析

2.1 实验材料与仪器

2.1.1 实验试剂与耗材

2.1.2 实验仪器

2.1.3 实验试剂配制

2.2 实验方法

2.2.1 粪便样本采集

2.2.2 粪便RNA提取

2.2.3 RNA浓度及纯度测定

2.2.4 粪便样本诺如病毒检测

2.2.5 RNA-Seq

2.2.6 测序数据处理

2.2.7 诺如病毒基因组序列分析

2.3 结果与分析

2.3.1 粪便样本诺如病毒检测结果分析

2.3.2 RNA-Seq结果分析

2.4 讨论

第三章 诺如病毒GI基因型特异性检测体系的设计

3.1 实验材料与仪器

3.1.1 实验试剂与耗材

3.1.2 实验仪器

3.1.3 实验试剂配制

3.2 实验方法

3.2.1 诺如病毒基因组序列搜集及整理

3.2.2 系统发育树构建

3.2.3 诺如病毒GI基因型特异性检测引物设计

3.2.4 RNA反转录

3.2.5 目的片段扩增

3.2.6 目的片段回收

3.2.7 TA克隆

3.2.8 蓝白斑筛选

3.2.9 菌落PCR

3.2.10 质粒小提

3.2.11 标准曲线建立及灵敏度检测

3.2.12 荧光定量PCR 检测粪便样本

3.3 结果与分析

3.3.1 诺如病毒基因组序列搜集结果

3.3.2 检测引物设计结果

3.3.3 检测引物的准确性

3.3.4 检测引物的特异性

3.3.5 标准曲线及灵敏度

3.3.6 荧光定量PCR模拟样本检测结果

3.4 讨论

结论

参考文献

致谢