罗氏沼虾诺达病毒的核酸检测及其部分序列分析

摘要

根据安替列群岛分离的罗氏沼虾诺达病毒株基因组序列 (MrNV ant) ,制备特异性核酸探针 ,设计特异性引物 ,用点杂交和RT PCR的方法检测在中国境内分离的罗氏沼虾诺达病毒 (MrNV chin)。点杂交的方法可以检测出少于 2 6ng的患肌肉白浊症的组织样品中的病毒 ,或少于 2 5ng的病毒RNA样品 ;RT -PCR可以检测出少于2 5 pg的RNA样品。扩增的MrNV chinRNA1序列长 85 8个核苷酸 ,与MrNV ant的核苷酸一致率为 95 7% ,两者翻译后的氨基酸序列的一致率为 99 7%。扩增的MrNV chinRNA 2序列长 1 1 2 1个核苷酸 ,与MrNV ant的核苷酸一致率为 92 % ,两者翻译后的氨基酸序列的一致率为 93 2 %。因此 ,MrNV ant和MrNV chin应属于同一种病毒的不同分离株。用两株罗氏沼虾诺达病毒的RNA聚合酶序列与其它 6株诺达病毒RNA聚合酶序列比较后构建的进化树中 ,罗氏沼虾诺达病毒与Alphanodavirus的亲缘关系近于与Betanodavirus的亲缘 。