细菌和酿酒酵母精简基因组设计

目录

声明

第一章 绪论

1.1 研究背景

1.2 必需基因研究进展

1.3 最小基因组研究进展

1.4 本文结构

第二章 细菌必需基因筛选与最小基因集构建

2.1 先前工作

2.2.1 物种数目更新

2.2.2 物种进化关系

2.3 半数保留法

2.3.1 半数保留法原理

2.3.2 样本数据

2.3.3 结果分析

2.4 代谢网络分析

2.5 细菌最小必需基因集

2.6 本章小结

第三章 细菌最小基因组设计

3.1 底盘细胞

3.2 最小基因组设计

3.2.1 蛋白编码必需基因筛选

3.2.2 RNA必需基因筛选

3.2.3 基因组设计原则

3.3 最小基因组结果

3.4 必需基因成簇分布现象

3.5 本章小结

第四章 酿酒酵母精简基因组设计

4.1 引言

4.2 功能多拷贝

4.3 基因互作与联合致死

4.4 必需性评级

4.5 本章小结

第五章 总结与展望

4.1 全文总结

4.2 未来工作的展望

致 谢

参考文献

攻读硕士学位期间取得的成果