声明
摘要
缩略词表
前言
第一章文献综述
1 植物逆境信号传导途径的研究进展
1．1冷和热胁迫信号
1．2渗透胁迫信号
1．3离子胁迫信号
1．4 ABA信号
2植物基因组的研究进展
2．1植物基因组测序的研究进展
2．2白菜基因组研究进展
2．3比较基因组学的应用
3植物基因组的多倍化
3．1 多倍化在植物进化中的作用
3．2基因组三倍化驱动芸苔属植物的多样化
4基因复制是植物进化的动力
4．1基因复制的分子机制
4．2复制基因的命运
4．3复制与物种的形成
5非编码RNA在植物逆境中的作用
5．1长链非编码RNA的特点
5．2识别和预测植物LncRNAs功能
5．3 LncRNAs对植物逆境的调节
6本研究的目的和意义
第二章MAPK级联基因在大白菜和植物系统中不同的进化模式
1 引言
2材料与方法
2．1材料
2．2试验方法
3结果与分析
3．1 MAPK级联基因在大白菜三倍化过程中的不同保留
3．2大白菜MAPK级联基因的结构特征分析
3．3 分析大白菜和拟南芥的MAPK级联基因的复制和Ks值
3．4 MAPK基因在植物中的扩张和进化
3．5 MAPKK基因在植物中的扩张和进化
3．6 MAPKKK基因在植物中的扩张和进化
3．7 比较分析MAPKKK级联基因在大白菜和拟南芥不同组织中的表达
3．8大白菜MAPKKK级联基因顺式元件和互作网络分析
4讨论
第三章比较分析大白菜CDPK-SnRK基因家族及其在植物中的进化意义
1引言
2材料与方法
2．1材料
2．2试验方法
3结果与分析
3．2 BrCDPK-SnRK蛋白结构特点和扩张分析
3．3 BrCDPK-SnRK在大白菜三倍化过程中的不同保留
3．4大白菜CDPK-SnRK基因的染色体分布和重复基因的分析
3．5 CDPK-SnRK基因在植物中的进化模式
3．6比较分析大白菜和拟南芥不同组织中的CDPK-SnRK基因表达模式
3．7大白菜CDPK-SnRK基因在逆境下的表达差异和共表达网络
4讨论
第四章大白菜TIFY基因家族全基因组分析鉴定和在逆境下的表达模式
1 引言
2材料与方法
2．1材料
2．2试验方法
3结果与分析
3．1 大白菜BraTIFY基因拷贝数的不同和差异保留
3．2大白菜TIFY基因的特性
3．3大白菜与拟南芥中TIFY直系同源基因和旁系同源基因
3．4Ks与复制基因的分析
3．5 TIFY的进化模式
3．6拟南芥和大白菜TIFY基因的表达模式分析
3．7不同胁迫下BraTIFY基因的表达
3．8多种胁迫下大白菜TIFY共表达网络
4讨论
第五章全基因组分析大白菜BES1转录因子
1 引言
2材料与方法
2．1 材料
2．2试验方法
3结果与分析
3．2 BES1基因的系统进化和分类
3．3大白菜BrBES1基因家族的染色体分布
3．4识别BES1的直系同源和旁系同源基因
3．5 BrBES1s在大白菜不同组织中的表达分析
3．6 BrBES1s在不同非生物胁迫下的表达模式
4讨论
第六章不结球白菜中LncRNA响应春化作用的分子机制
1 引言
2材料与方法
2．1材料
2．2试验方法
3结果与分析
3．1不结球白菜中LncRNAs的表达
3．2分类注释LncRNAs
3．3 RNA-Seq鉴定与春化相关的LncRNAs和mRNAs
3．4差异表达的LncRNAs和mRNAs的功能分析
3．5确定与春化相关的转录因子
3．6植物春化过程中植物激素含量的变化
4讨论
全文结论
创新点
参考文献
论文发表情况
致谢
南京农业大学;
