鸡蛋含量相关性研究胆固醇代谢候选基因SNPs筛查及其与蛋黄胆固醇

摘要

本研究以贵妃鸡为试验素材，研究与鸡蛋胆固醇含量调控相关候选基因Apo-Ⅱ基因、OVR基因和VTGⅡ基因的单链核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms，SNPs)及其与蛋黄胆固醇含量(Content of Cholesterol in eggyolk)之间的关系。
　　 根据GenBank上的基因序列共设计11对引物，采用PCR-SSCP技术，分别对贵妃鸡Apo-Ⅱ基因的第2和第3外显子、OVR基因第1和第2外显子、VTGⅡ基因第6、22、26、27、33、34、35外显子进行PCR扩增，进行聚丙烯酰胺凝胶电泳并测序，筛查SNP位点分析其多态性；同时探讨各调控基因与蛋黄胆固醇含量之间的相关性，从而为低胆固醇蛋鸡品系的育种工作提供分子标记。经研究发现：
　　 1、在Apo-Ⅱ基因的第2和第3外显子、OVR基因的第1和第2外显子均未发现多态位点。
　　 2、VTGⅡ基因第6、22、27、34、35外显子未找到多态位点。第26、33外显子共发现4个位点。分别为C13161T、A17698T、T17719G、G17764A。C13161T位点在实验群体中只检测到CC和CT两种基因型，该突变没有引起氨基酸的变化。A17698T位点只检测到TT和AT两种基因型；该突变位于内含子上。T17719G位点检测到TT、TG、GG三种基因型；该突变导致色氨酸变为甘氨酸。G17764A位点检测到GG和GA两种基因型；该突变导致谷氨酸变为赖氨酸。两处突变均对表达的蛋白特性产生影响。
　　 3、x2检验表明，C13161T位点和A17698T处于Hardy-Weinberg平衡，T17719G和G17764A两个位点处于Hardy-Weinberg不平衡状态。遗传多态性分析表明，C13161T和A17698T位点处于低度多态，T17719G和G17764A两个位点处于中度多态，其中G17764A位点的多态性最高，变异程度最大，存在较大的选择潜力。总体反映了该群体具有较为丰富的遗传多样性。
　　 4、统计分析表明：贵妃鸡VTGⅡ基因Exon26中C13161T位点产生的两种基因型个体间蛋黄胆固醇含量差异不显著(P＞0.05); Exon33中检测到的三处多态位点共产生五种基因型，不同基因型个体间蛋黄胆固醇含量差异均不显著。