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鸡肉IMP含量相关候选基因SNP筛查及其用于地方鸡种群体遗传结构分析的研究

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目录

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论文说明:资助、缩略词表

第一章文献综述

1风味物质

2肌苷酸作为风味物质研究进展

2.1肌苷酸的风味特性

2.2影响肌肉肌苷酸含量的因素

2.3鸡肌肉肌苷酸含量的遗传力

2.4 IMP的合成代谢

2.5 IMP合成酶系基因的研究概况

3.候选基因法在畜禽遗传育种中的应用

3.1候选基因与表型性状间的连锁分析

3.2连锁关系的验证

3.3候选基因法用于鸡肉品质性状的研究

4利用分子标记评估群体遗传结构及遗传分化

4.1线粒体DNA

4.2基因组DNA

5本研究目的意义

第二章不同鸡种肌肉肌苷酸含量的比较研究

1引言

2材料与方法

2.1实验动物

2.2实验方法

2.3统计分析

3结果与分析

3.1不同鸡种母鸡胸肌IMP含量的比较

3.2地方鸡种肌肉IMP含量与体重的相关性

4讨论

4.1不同鸡种胸肌IMP含量的比较

4.2肌肉IMP含量与体重相关性分析

第三章鸡ADSL基因的单核苷酸多态性及其与肌肉IMP含量的关联分析

1引言

2材料与方法

2.1实验动物

2.2主要溶液的配制

2.3引物设计合成

2.4主要实验步骤

3相关软件与统计方法

3.1相关软件

3.2统计方法

4结果与分析

4.1 ADSL基因SNP筛查结果

4.2 ADSL基因各SNP位点在5个鸡群体中的基因频率和基因型分布

4.3 ADSL基因与12周龄母鸡胸肌IMP含量的关联分析

5讨论

5.1鸡肉IMP含量相关候选基因的研究

5.2 ADSL基因外显子9的C9839A突变(ADSL4位点)

5.3鸡ADSL基因的ADSL1位点与肌肉IMP含量的关系

5.4关于ADSL基因5’侧翼序列的研究

第四章 鸡GARS-AIRS-GART基因的单核苷酸多态性及其与肌肉IMP含量的关联分析

1引言

2材料与方法

3结果与分析

3.1 GARS-AIRS-GART基因SNP筛查结果

3.2 GARS-AIRS-GART基因各SNP位点在五个鸡群体中的基因频率和基因型分布

3.3 GARS-AIRS-GART基因与12周龄鸡胸肌IMP含量的关联分析

4讨论

4.1鸡GARS-AIRS-GART基因单核苷酸多态性

4.2鸡GARS-AIRS-GART基因的单核苷酸多态性与肌肉肌苷酸含量的关系

第五章 利用SNP标记、微卫星标记分析4个地方鸡种群体遗传结构及遗传分化

1前言

2资料来源

3统计分析

3.1四个群体15个SNP位点基因频率的抽样估计

3.2群体间的遗传分化及遗传距离

3.3品种聚类

4结果与分析

4.1各SNP位点基因频率估计值的方差及可靠性

4.2群体间的遗传分化

4.3四个鸡种群体间的亲缘关系

5讨论

5.1由微卫星数据推断的4个地方鸡种群体遗传分化与遗传结构

5.2由SNP数据推断的推断的4个地方鸡种群体遗传结构

5.3两类型标记用于群体遗传结构分析之比较

全文结论

参考文献

致谢

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摘要

本研究以鸡肌苷酸合成代谢相关酶中的腺苷琥珀酸裂解酶(ADSL)基因、甘氨酰胺核苷酸合成酶(GARS)、5-氨基咪唑核苷酸合成酶(AIRS)和甘氨酰胺核苷酸转甲基酶(GART)基因为候选基因,在泰和乌骨鸡、萧山鸡、白耳鸡、藏鸡等4个地方鸡种以及1个外来鸡种-隐性白羽肉鸡群体中对鸡ADSL、GARS-AIRS-GART基因进行单核苷酸多态性(SNP)扫描并分析其与地方鸡种肌肉肌苷酸含量之间的关系;同时分别利用29对微卫星引物以及在两个候选基因ADSL、GARS-AIRS-GART中所检测到的15个SNP位点对我国的4个地方鸡种的群体遗传结构及遗传分化进行评估。  本研究分别利用29个微卫星标记、两个候选基因中所检测出的15个SNP标记分析4个地方鸡种的亲缘关系,计算群体遗传分化系数,分别应用基于Reynolds遗传距离运用NJ聚类法以及适用于多位点数据用于推断群体结构的structure程序估计群体的遗传结构。

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