巢湖鸭脂肪代谢相关基因SNPs与肉质性状的关联分析

摘要

禽类肉质嫩度和风味与其肌肉肌内脂肪含量密切相关。为研究安徽省地方品种巢湖鸭肉质生理和遗传特性，本试验以12周龄巢湖鸭为研究对象，索氏抽提法测定巢湖鸭胸、腿肌肌内脂肪含量，PCR-SSCP分析脂肪沉积相关候选基因ApoVLDL-Ⅱ、A-FABP、CYP7A1的遗传变异及其与肉质性状的相关性；同时采用RT-PCR技术检测各基因型间的表达差异，探讨表达量与肉质性状的关系。研究结果将为地方鸭脂肪性状候选分子标记开发提供参考依据。具体研究结果如下：
　　1.巢湖鸭肉质性状分析
　　分别测定巢湖鸭胸、腿肌 IMF、PH、嫩度、失水率、胸、腿肌率等肉质性状指标。公鸭的腿肌IMF含量(1.75％±0.85%)与母鸭的(1.81%±0.85%)无显著差异(P>0.05)，但公鸭的胸肌 IMF含量(2.08%±0.69%)显著高于母鸭(1.74%±0.60%)(P<0.05)；胸、腿肌的PH值在6.51～6.75之间，胸、腿肌的失水率在0.74%～0.78%之间，胸肌率和腿肌率在0.10%～0.14%之间；公鸭的胸、腿肌嫩度分别为12.41 kg±6.61 kg和7.97 kg±8.46 kg，母鸭的胸、腿肌嫩度分别为12.72 kg±6.06 kg和18.10 kg±6.12 kg，但公母鸭之间无显著差异(P>0.05)。
　　2.巢湖鸭脂肪性状相关候选基因SNP位点
　　基因ApoVLDL-Ⅱ在688位点检测到A→G突变，位于内含子1区域，群体分为MM、MH、HH型，基因型频率分别为0.57、0.36、0.07，在2723、2743位点检测到C→T和T→C突变，位于内含子3区域，群体分为CC、CT、TT型，基因型频率分为别0.59、0.34、0.07，此两位点的有效等位基因数为1.60、1.57，杂合度分别为0.38、0.36，多态信息含量分别为0.30、0.30，属于中度多态，均处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05)。
　　基因A-FABP共检测到3个SNPs，分别为A321G、T944C、C1054T，均位于内含子1，321位点处产生3种基因型，分别命名为BB、BD、DD型，基因型频率分别为0.55、0.35、0.10，944和1054位点处产生2种基因型，分别命名为AA、AG型，基因型频率分别为0.26、0.74，两位点的有效等位基因数为1.66、1.88，杂合度分别为0.40、0.47，多态信息含量分别为0.32、0.36，属于中度多态，该群体在321位点偏离哈代—温伯格平衡状态(P<0.01)，而在944和1054位点处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05)。
　　基因CYP7A1在外显子1检测到一处C203T突变，产生两种基因型，分别命名为EE、EF型，基因型频率为0.89、0.11，该位点的有效等位基因数为1.12，杂合度为0.10，多态信息含量为0.09，属于低度多态，处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05)。
　　3.巢湖鸭相关候选基因多态与表达量、肉质性状的关联分析
　　基因 ApoVLDL-Ⅱ各基因型的表达量无显著差异(P>0.05)，HH型的胸肌IMF、腿肌IMF、胸肌嫩度和腿肌嫩度值均高于MM和型和MH型，公鸭的胸肌IMF显著高于母鸭(P<0.05)，公鸭的腿肌嫩度极显著高于母鸭(P<0.01)；TT型的腿肌IMF含量极显著高于CC型和CT型(P<0.01)，TT型的胸肌IMF、胸肌嫩度和腿肌嫩度值均高于CC型和CT型，公鸭的胸肌IMF含量和腿肌嫩度显著高于母鸭(P<0.05)。
　　基因A-FABP各基因型的表达量无显著差异(P>0.05)，BB型和BD型的胸肌嫩度和腿肌嫩度极显著高于DD型(P<0.01)，但BB型和BD型之间无显著差异(P>0.05)；母鸭的胸肌嫩度显著高于公鸭(P<0.05)。
　　各基因型和性别在 CYP7A1基因的胸肌 IMF、腿肌 IMF、胸肌嫩度、腿肌嫩度、胸肌率、腿肌率指标以及表达量上无显著差异(P>0.05)。
　　研究结果显示，ApoVLDL-Ⅱ和A-FABP基因可作为巢湖鸭肉质性状选育的候选基因。

目录

封面

声明

中文摘要

英文摘要

目录

缩略词（Abbreviation）

文献综述

1 巢湖鸭特性及应用前景

2 肌内脂肪的沉积

3 ApoVLDL-Ⅱ基因参与脂肪沉积

4 A-FABP基因参与脂肪沉积

5 CYP7A1基因参与脂肪沉积

引言

1 材料与方法

1.1 试验材料

1.2 试验方法

1.3 统计分析方法

2 结果与分析

2.1 巢湖鸭的肉质性状分析

2.2 基因遗传多态性分析

2.3 ApoVLDLⅡ、A-FABP、CYP7A1各基因型荧光定量表达分析

2.4 ApoVLDL-Ⅱ、A-FABP、CYP7A1基因多态、表达量和巢湖鸭肉质性状的关联分析

3 讨 论

3.1 巢湖鸭群体遗传多样性分析

3.2 巢湖鸭肌内脂肪含量分析

3.3 ApoVLDL-Ⅱ、A-FABP、CYP7A1基因多态、基因型表达与肉质性状的影响

3.4 ApoVLDL-Ⅱ、A-FABP、CYP7A1基因SNPs检测分析

4 结 论

参考文献

致谢

作者介绍