胃癌相关的竞争性内源RNA调控网络的构建和分析

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声明

主要英文缩略词表

1 引言

2 材料与方法

2.1 材料

2.1.1 数据库

2.1.2生物信息分析软件

2.2.3 组织来源

2.2.4 Agilent miRNA 表达谱芯片

2.2.5 Agilent G3 Human 8×60K芯片

2.2.6主要试剂

2.2.7仪器设备

2.2方法

2.2.1生物芯片技术进行基因表达谱测定

2.2.2差异表达DEmiRNA，DElncRNA，DEmRNA鉴定

2.2.3 Go功能富集分析和KEGG通路富集分析

2.2.4 TCGA数据库数据下载并验证部分差异表达基因

2.2.5 ceRNA网络可视化并筛选hub基因

2.2.6 生存分析

3结果

3.1 鉴定DEmRNA，DEmiRNA 和DElncRNA

3.2 差异基因生物学功能及通路分析

3.3 TCGA 数据库数据下载验证部分差异 mRNAs、miRNAs 和lncRNAs在胃癌及癌旁组织中的表达结果

3.4 ceRNA网络图

3.5 筛选与胃癌患者预后相关的hub 基因

4 讨论

5 结论

参考文献

综述:竞争性内源性RNA在胃癌中的研究进展

参考文献

个人简历和攻读硕士期间发表论文

致 谢