食管鳞癌血清蛋白指纹图谱诊断模型的研究

摘要

目的：分析新疆食管鳞癌血清蛋白指纹的表达并建立其诊断模型，为食管癌的诊断与临床筛查提供新的途径。 方法：采用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)和弱阳离子交换芯片(CM10 chip)分析188例样本，其中139例新疆食管鳞癌患者(包括维吾尔族54例，哈萨克族45例，汉族40例)和49例性别、年龄相匹配的健康人(包括维吾尔族28例，哈萨克族10例，汉族11例)血清蛋白的表达图谱。随机抽取其中135例标本(食管鳞癌104例，正常人31例)作为训练组，应用支持向量机(SVM)分析表达图谱数据，并建立食管癌诊断模型，用留一法验证该模型。用53例样本(食管鳞癌35例，正常人18例)盲法测试以评价该模型。 结果：在分子量0～50 000范围内，共检测到283个蛋白峰，其中140个差异有显著意义(P＜0.05)。建立了由6个差异蛋白其质荷比(M/Z)分别为5667.1843、5709.597、5876.2093、5979.2029、6043.524、6102.8172所组成的食管癌诊断模型，其灵敏度为97.12％，特异度为83.87％，扩大样本盲法验证结果显示其灵敏度为91.43％，特异度为88.89％。 结论：应用SELDI-TOF-MS技术和生物信息学技术筛选出的6个差异蛋白所组成的诊断模型具有较好的敏感性和特异性，为新疆食管鳞癌的诊断提供了一种无创伤性的辅助诊断方法。

目录

论文说明：英文缩略语表

声明

摘要

前言

材料与方法

1.材料

1.1食管鳞癌患者血清和健康人血清采集

1.2质量控制血清采集

1.3主要实验设备和耗材

1.4主要的实验试剂

1.5主要实验试剂的配制方法

2.实验方法

2.1仪器调校

2.2实验设计

2.3实验流程

2.4芯片检测、数据采集和参数设置

2.5数据处理及统计学分析

2.6诊断模型的验证

结果

讨论

小结

致谢

参考文献

综述 SELDI-TOM-FS技术的研究及应用现况

攻读硕士学位期间发表的学术论文