三个品种马MSTN、GH基因多态性及其与体尺性状的关联分析

摘要

本试验以焉耆马、伊犁马和蒙古马3个品种所采集的196个个体为材料，采用PCR-SSCP及DNA测序技术，在DNA水平上对MSTN及GH基因多态性进行研究，并将基因多态性与马体尺性状进行关联性分析。研究结果如下:
　　对MSTN基因的多态性检测，其中焉耆马和伊犁马存在多态性，产生了AA、AG和GG三种基因型;蒙古马未检测到多态性。经DNA测序，发现在第一内含子区域一个碱基发生突变:g.2115A→G(GQ183900.1)。通过Hardy-Weinberg平衡检验，在焉耆马与伊犁马中MSTN基因处于Hardy-Weinberg非平衡状态。
　　对GH基因进行多态性检测，发现所测三个品种均存在多态性，产生了CC、CD及DD三种基因型。经DNA测序，在第五外显子区域检测到一个突变位点g.1464T→C(NC_009154.2)。通过Hardy-Weinberg平衡检验，发现焉耆马与伊犁马GH基因处于Hardy-Weinberg平衡状态，蒙古马处于Hardy-Weinberg非平衡状态。
　　MSTN基因不同基因型与体尺性状进行相关性分析表明，在焉耆马和伊犁马群体中，不同的基因型对体尺性状产生了显著性的影响。其中焉耆马群体中胸围GG型和AG型显著长于AA型;伊犁马群体中体长GG型显著长于AA型，胸围GG型显著长于AG型，极显著长于AA型，管围AG型极显著长于AA型。使用一般线性模型GLM对所测三个品种马匹体尺进行方差分析，发现不同品种差异及不同基因型对体尺差异均有极显著意义。
　　蒙古马GH基因不同基因型与体尺性状进行相关性分析表明，不同的GH基因型对体尺性状产生了显著性的影响，蒙古马群体中，体高、体长和胸围CC型和CD型显著性高（长）于DD型，管围CC型显著长于DD型。
　　MSTN及GH基因对马体尺性状具有显著性影响，在马匹育种与改良过程中具有作为分子标记辅助的价值。

目录

声明

论文说明

摘要

第1章 绪论

1．1 国内外马产业研究现状

1．1．1 国外马产业发展现状

1．1．2 国内马产业发展现状

1．1．3 新疆马产业发展现状

1．2 国内主要马品种

1．2．1 伊犁马

1．2．2 焉耆马

1．2．3 蒙古马

1．3 DNA标记技术的研究进展

1．3．1 DNA标记技术及其发展进程

1．3．2 DNA标记技术分类及标记方法

1．3．3 单核苷酸多态性

1．3．4 PCR-SSCP分析法

1．3．5 遗传标记在家畜育种中的应用

1．4 肌肉生长抑制素基因(MSTN)的研究进展

1．4．1 肌肉生长抑制素基因(MSTN)的概念

1．4．2 肌肉生长抑制素基因(MSTN)的结构特点

1．4．3 MSTN基因的调控与表达

1．4．4 肌肉生长抑制素基因(MSTN)的生物学功能

1．5 生长激素(GH)的研究进展

1．5．1 生长激素(GH)的简介

1．5．2 生长激素(GH)的结构特点

1．5．3 GH基因的调控和表达

1．5．4 生长激素(CH)的生物学功能

1．6 本研究的目的及意义

第2章 试验材料和方法

2．1 试验材料

2．1．1 试验材料的采集

2．1．2 主要药品和试剂

2．1．3 主要试验仪器

2．1．4 溶液的配制

2．2 试验方法

2．2．1 血液基因组DNA的提取与检测

2．2．2 PCR引物

2．2．3 PCR反应条件体系和反应程序

2．2．4 PCR产物的聚丙烯酰胺凝胶电泳检测步骤

2．2．5 DNA测序

2．3 数据统计与分析

2．3．1 基因频率与基因型频率的计算

2．3．2 基因座遗传纯合度、杂合度、有效等位基因数和多态信息含量

2．4 数据处理

第3章 结果与分析

3．1 三个品种马体尺差异性分析

3．2 DNA提取结果检测

3．3 马MSTN基因SNP检测及其与生长发育性状相关性

3．3．1 PCR扩增结果检测

3．3．2 PCR-SSCP结果

3．3．3 测序结果与分析

3．3．4 遗传参数统计计算分析

3．3．5 MSTN基因的遗传参数值

3．3．6 MSTN不同基因型与体尺间的关联性分析

3．4 马GH基因SNP检测及其与生长发育性状相关性

3．4．1 PCR扩增结果检测

3．4．2 PCR-SSCP结果

3．4．3 测序结果与分析

3．4．4 遗传参数统计计算分析

3．2．5 GH基因的遗传参数值

3．2．6 不同基因型与蒙古马体尺间的关联性分析

第4章 讨论

4．1 三个品种马体尺差异性分析

4．2 MSTN基因的多态性分析

4．3 MSTN基因的遗传变异分析

4．4 MSTN基因多态性与马体尺的关联分析

4．5 GH基因PCR-SSCP

4．6 GH基因的遗传变异分析

4．7 GH基因多态性与马体尺的关联分析

第5章 结论

参考文献

致谢

作者简介