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声明
第一章绪论
1.1引言
1.2序列比对的现状
1.3本文所做的工作
第二章双序列比对基础
2.1序列比对的基本概念
2.1.1序列比对的定义
2.1.2替换矩阵
2.1.3空位罚分
2.1.4目标函数
2.2双序列比对算法
2.2.1点阵分析
2.2.2动态规划算法
2.2.3词或k-串方法
2.3本章小结
第三章DNA序列比对的最大似然度方法
3.1 DNA序列进化模型
3.1.1替换过程
3.1.2插入/删除过程
3.2最大似然度序列比对算法
3.2.1双序列比对的似然度表达式
3.2.2进化参数估计算法
3.2.3比对算法
3.3实验数据和结果分析
3.3.1实验说明
3.3.2实验数据
3.3.3结果分析
3.4本章小结
第四章 结论与展望
附录
致谢
参考文献
研究成果