基于SSR分子标记的燕麦属种质遗传多样性研究与核心种质构建

摘要

我国燕麦种质资源丰富，种植历史悠久，燕麦各个品种之间相互混杂，燕麦的遗传背景与育种研究起步较晚，极大的限制了我国燕麦产业的发展，因而构建燕麦核心种质资源不失为解决这一问题的有效手段。并且随着科技的进步以及对燕麦种质资源研究的重视，人们开始从分子水平对燕麦种质资源进行了研究。本文通过实验操作简便的SSR分子标记，对国家草种质资源库现有的燕麦种质资源进行了核心种质构建和遗传多样性分析。
　　本文试验结果如下所示：
　　（1）多态性引物的筛选：用磁珠富集法得到含有微卫星的片段，通过测序设计了150对SSR引物，并对10种燕麦品种材料进行聚丙烯酰胺凝胶电泳检测，筛选得到了6对多态性高且扩增条带清晰的燕麦微卫星引物，分别为M202、M8、M70、M197、M236和M161。通过查找文献，得到115对报道有较高多态性且扩增稳定的燕麦微卫星引物，用同样的品种材料进行检测，多次筛选得到14对引物用于该实验燕麦核心种质的遗传多样性分析。这14对引物分别为AM610、AM32、AM17、AM20、AM31、AM38、AM1000、AM14、AM24、L39777、AF033096、AM447、AM1789、AM759和AM1266。
　　（2）品种鉴定及指纹图谱的构建：利用课题组研发筛选出的6对引物，对10个燕麦品种进行PCR扩增，共检测45个多态性片段，构建了10个燕麦品种的SSR分子标记的DNA指纹图谱。
　　（3）核心种质构建及遗传多样性分析：从国家草种质资源库现有的3132份燕麦属种质材料中筛选出327份构建了资源库燕麦属的核心种质。利用筛选出的20对引物对327份燕麦属核心种质资源进行遗传多样性分析，共扩增出131条带，其中多态性条带106条，多态性比率为77.71％。每条引物扩增的条带在4-8条之间，平均为5.30条。扩增产物长度介于150-l000bP，以200-750bp的扩增片段居多。扩增条带数最少的引物为M8、AM32、AM24、M236、AM447和AM1759，扩增出的条带为4条;扩增条带数最多的引物为M197，达8条。通过聚类分析可知，327份燕麦属种质资源具有较高的遗传多样性。