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整合分析TCGA转录组数据构建ceRNA网络诠释三阴性乳腺癌潜在的预后指标

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摘要

第一章绪论

1.1竞争内源性RNA(ceRNA)在乳腺癌中的研究进展

1.1.1 ceRNA网络的ncRNA元件

1.1.2 ceRNA在乳腺癌发生和发病机制中的相互作用

1.1.3小结

1.2通过数据库鉴定乳腺癌生物靶标

1.2.2 GENE EXPRESSION OMNIBUS

1.2.3 EMBASE

1.2.4小结

1.3本课题研究内容

第二章实验方案设计与研究方法

2.1数据下载及预处理

2.2差异表达基因的筛选

2.3差异表达基因的基因本体论及通路富集分析

2.4 ceRNA网络的构建

2.6 ceRNA的预后分析

2.7细胞培养

2.8 RNA的提取与逆转录实时定量聚合酶链式反应

3.1差异表达基因的筛选

3.2差异表达基因的GO和通路富集分析

3.3 ceRNA调控网络的构建

3.4 ceRNA网络中mRNA的通路及GO分析,以及PPI网络的构建

3.5 ceRNA网络节点的生存分析

3.6在正常及三阴性乳腺癌细胞中的TRIML2的表达量

第四章结论与展望

参考文献

致谢

附录

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