癌症中TP53变异的研究

摘要

目的：肿瘤抑制基因TP53的突变是许多癌症发生发展的重要危险因素之一，本次研究通过观察TP53在癌症中突变的普遍规律及个别癌症中的突变特征，探寻TP53突变在不同癌症中的相互关系。
　　方法：通过IARC TP53 Database数据库中的TP53突变数据统计，对TP53突变位点，碱基置换，氨基酸置换，二级结构中突变及氨基酸置换变异率进行统计分析。
　　结论：
　　1.癌症中TP53突变高发位点都集中在175，248和273热点上，不同癌症高发的位点不同，肺癌中较为特殊的热点为157和158。
　　2.大多数癌症最为高发的碱基置换为CpG处的G:C>A:T置换，肝癌和肺癌以G:C>T:A置换最多见。
　　3.在所有癌症中，以精氨酸>组氨酸最为常见，同时发生突变最多的氨基酸为精氨酸，除了肝癌中最易突变成丝氨酸外，其他大多数癌症突变形成最多的为组氨酸及半胱氨酸。氨基酸分类后，最常见的突变为疏水氨基酸>疏水氨基酸。
　　4.在二级结构中发生的突变占总体的68％。
　　5.大多数癌症高发的突变为：R175H、R248W、R248Q、R273C、R273H、R282W。个别癌症较有特异性的突变：R249S--肝癌；G245S--结直肠癌；C176F--食管癌；R280T、E285K--膀胱癌；Y220C、I195T--卵巢癌；V157F、R158L、R273L、R248L--肺癌；G245C--肺癌和头颈部癌。
　　6.在聚类分析及相关性分析中发现，结直肠癌和脑恶性胶质瘤在某些突变分析中存在一定相似性，肝癌和肺癌在TP53突变中有着较为明显的特征。

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1 引言

2 研究方法

3 癌症中TP53突变研究

3.1 癌症中TP53变异位点分析

3.2 癌症中TP53碱基置换类型研究

3.3 癌症中TP53氨基酸置换变异研究

3.4 癌症中TP53在蛋白质二级结构中突变的研究

3.5 癌症中TP53氨基酸置换变异率的研究

4 讨论

5 结论

参考文献

综述

附录

致谢