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东南大学学位论文独创性声明和使用授权声明
第一章绪论
1.1中药品种鉴定在中药质量控制中的地位与发展
1.1.1中药品种的现状
1.1.2中药品种鉴定是中药质量控制的首要环节
1.1.3中药品种分类鉴定依据及方法的发展
1.1.4研究范围从物种间深入到物种内
1.1.5研究手段不断推陈出新
1.1.6研究思路呈现出多元化的发展
1.2中药鉴定的主要方法及其发展
1.2.1基原鉴定法
1.2.2性状鉴定法
1.2.3显微鉴定法
1.2.4理化鉴定法
1.2.5生物鉴定法
1.2.6存在的问题与发展方向
1.3本课题的主要目标及研究内容
参考文献
第二章实验材料与技术路线
2.1实验材料概述
2.1.1石斛的药用价值与分类
2.1.2中药石斛鉴定的意义
2.1.3石斛的鉴定现状
2.1.4临床应用
2.2中药鉴定gDNA芯片主要技术路线
2.2.1种质特异性探针的筛选
2.2.2种质特异性探针制备DNA芯片(DNA微阵列)
2.2.3待鉴样品DNA的提取、扩增及标记
2.2.4检测样品DNA与芯片杂交
2.2.5结果检测与分析
附图
参考文献
第三章特异性探针的筛选-“SSH-array”技术
3.1抑制性差减杂交
3.1.1 SSH技术的基本原理
3.1.2主要过程
3.2试验材料与研究方法
3.2.1试验材料和仪器
3.2.2基因组DNA的提取与检测
3.2.3 gDNA的酶切
3.2.4接头、引物的设计与接头连接
3.2.5抑制性差减杂交
3.2.6差减产物的PCR扩增
3.2.7 PCR产物的胶回收柱子纯化
3.2.8差减PCR产物的克隆
3.2.9差异克隆的扩增与标记
3.2.10用于筛选探针的gDNA微阵列的制备
3.2.u DIG标记的差减克隆与gDNA微阵列的杂交筛选
3.3实验结果与讨论
3.3.1石斛DNA的检测
3.3.2 Rsa I酶切效果
3.3.3差减杂交及PCR扩增产物检测
3.3.4差减PCR产物的有效纯化
3.3.5差减杂交PCR产物的克隆及阳性克隆率
3.3.6探针特异性与筛选效率分析
3.3.7特异性探针的物种鉴定的有效性
3.3.8特异性探针杂交图象与序列分析
参考文献
第四章多重探针的物种鉴定研究-“MSSP”技术
4.1材料与方法
4.1.1试验材料和仪器
4.1.2主要试剂
4.1.3用于多重探针试验标准样品的准备
4.1.4试验样品的DNA提取与检测
4.1.5 gDNA的酶切与接头连接
4.1.6多重探针(multiple species-specific gDNA probes,MSSP)DNA阵列的制备
4.1.7 DIG标记的gDNA和DNA阵列的杂交
4.1.8杂交结果的检测和分析
4.2实验结果与讨论
4.2.1多重探针的序列分析
4.2.2试验样本gDNA酶切与标记效果
4.2.3杂交温度的优化分析
4.2.4多重探针物种鉴定的准确性
参考文献
第五章基因组遗传多态性研究“Diversity SSH-array”技术
5.1材料与方法
5.1.1实验材料
5.1.2样本gDNA提取与纯化
5.1.3 SSH及差减片段的克隆
5.1.4差减片段的扩增
5.1.5多样性微阵列的制备
5.1.6样本gDNA的地高辛(DIG)标记
5.1.7 DIG标记gDNA与多样性微阵列的杂交
5.1.8杂交结果的检测与分析
5.2结果与讨论
参考文献
第六章特异性引物的筛选与扩增
6.1材料与方法
6.1.1实验材料
6.1.2试剂与仪器
6.1.3样本DNA的提取
6.1.4引物的设计
6.1.5 PCR的扩增与产物的纯化
6.2结果与讨论
附录:实验试剂及配方
博士研究生期间发表的主要论文
博士研究生期间主要申请专利
博士研究生期间承担的主要研究课题
博士研究生期间GenBank收入的基因组核酸序列
致谢