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5-AzA-dc逆转非小细胞肺癌细胞顺铂耐药相关microRNA的筛选鉴定

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摘要

缩略词简表

前言

第一章 材料与方法

1.1 主要材料和仪器

1.2 实验方法

1.3 统计学处理

第二章 结果

2.1 A549/DDP细胞的耐药性验证

2.2 验证5-Aza-dc对A549/DDP细胞顺铂耐药的逆转作用

2.3 筛选5-Aza-dc诱导A549/DDP细胞后差异表达的miRNA

2.4 荧光定量RT-qPCR验证miRNA芯片结果

2.5 逆转A549/DDP顺铂耐药相关miRNA的生物信息学分析

第三章 讨论

第四章 结论

参考文献

综述 microRNA在肺癌中的研究进展

攻读学位期间主要的研究成果

致谢

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摘要

研究背景:
  顺铂是非小细胞肺癌(NSCLC)最主要的化疗药物,但易产生耐药性,如何改变NSCLC耐药性及耐药逆转机制研究是当前的热点之一。我们前期研究表明,5-氮-2'-脱氧胞苷(5-Aza-dc)可逆转NSCLC细胞的顺铂耐药性,但具体机制不明。最近研究显示,microRNA(miRNA)与肿瘤顺铂耐药相关,而5-Aza-dc可影响肿瘤细胞的miRNA表达谱。因而我们推测:miRNA可能在5-Aza-dc诱导的NSCLC细胞顺铂耐药逆转中发挥重要调控作用。本实验通过检测5-Aza-dc诱导前后的耐顺铂细胞株A549/DDP细胞中miRNA表达谱变化,及预测分析miRNA的靶基因,探讨miRNA是否与5-Aza-dc诱导的NSCLC细胞顺铂耐药逆转相关,为深入研究5-Aza-dc逆转顺铂耐药的miRNA调控机制提供基础。
  研究目的:
  探讨miRNA是否与5-Aza-dc诱导的NSCLC细胞顺铂耐药逆转相关;初步筛选出调控5-Aza-dc逆转NSCLC细胞顺铂耐药过程的相关miRNA及靶基因。
  研究方法:
  以MTT法检测A549/DDP细胞对顺铂的耐药指数及5-Aza-dc对A549/DDP细胞的耐药逆转作用。miRNA芯片技术检测5-Aza-dc诱导A549/DDP细胞后miRNA表达谱差异;quantitative real-timePCR(RT-qPCR)验证芯片结果。生物信息学方法预测miRNA的靶基因,并对靶基因进行GO分析及KEGG信号通路分析。
  结果:
  1.A549细胞和A549/DDP细胞对顺铂的IC50分别为6.79±1.58μM,39.39±2.86μM,耐药指数RI为5.80,该A549/DDP细胞鉴定为对顺铂耐药的肺癌细胞株。无毒剂量20μM5-Aza-dc诱导后的A549/DDP细胞对顺铂的IC50下降为17.21±3.13μM,耐药逆转指数为2.29,20μM5-Aza-dc诱导对A549/DDP细胞有明显的耐药逆转作用。
  2.总RNA质检显示样本纯度高,完整性好,符合miRNA芯片要求。miRNA芯片结果显示经5-Aza-dc诱导细胞后有131条差异表达的miRNA,其中43条miRNA(27条上调,16条下调)表达差异倍数在2倍以上,两个样品芯片杂交信号值均在100以上。RT-qPCR结果显示与miRNA芯片结果趋势相似。
  3.生物信息学预测了miRNA如miR-320a,let-7b,miR-548j的靶基因,并分析靶基因的生物学功能及相关信号通路,从中初步筛选出可能介导5-Aza-dc逆转NSCLC细胞顺铂耐药的相关靶基因,如BCL2L1,SMAD2,E2F3等,并分析得到靶基因相关的MAPK信号通路,Wnt信号通路,JAK/STAT信号通路,PPAR信号通路,凋亡相关通路,药物代谢等信号通路,提示miRNA可能通过影响这些通路活性参与调控5-Aza-dc诱导的NSCLC细胞顺铂耐药逆转。
  结论:
  miRNA可能与5-Aza-dc诱导的NSCLC细胞顺铂耐药逆转相关,其机制可能是通过影响靶基因如BCL2L1,SMAD2,E2F3等的表达,进而调控NSCLC细胞的顺铂耐药逆转过程。

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