声明
摘要
缩略词索引
第一章 前言
1.1 中国传统医药学面临的挑战与机遇
1.2 中药靶标发现的策略
1.2.1 基因组技术
1.2.2 蛋白质组技术
1.2.3 生物信息学技术
1.3 中药四物汤、紫草的研究进展
1.3.1 四物汤研究进展
1.3.2 紫草研究进展
1.4 中药基因芯片研究方法概述
1.5 基于双聚类算法的基因共表达模块分析
1.6 本课题的研究目的和意义
第二章 材料与方法
2.1 数据资源
2.2 主要硬件及软件
2.3 基因共表达模块的划分
2.3.1 芯片预处理
2.3.2 数据合并及均一化
2.3.3 用FABIA算法进行双聚类计算
2.4 基因共表达模块的分析
2.4.1 基因共表达模块GO和KEGG的富集分析
2.4.2 计算小分子相似性
2.4.3 靶标预测及富集分析
第三章 结果与讨论
3.1 基因共表达模块特征分析
3.1.1 模块功能分析
3.1.2 基于模块的药物分子之间的相似性评估
3.1.3 靶标预测及富集分析
3.2 四物汤芯片双聚类结果分析
3.2.1 四物汤的靶标预测
3.2.2 四物汤的雌激素活性与内分泌调节作用
3.2.3 四物汤的抗氧化作用分析
3.2.4 四物汤活血化瘀机理分析
3.2.5 四物汤的其他作用分析
3.3 紫草素芯片双聚类结果分析
3.3.1 紫草素的靶标预测
3.3.2 紫草素的作用机制分析
第四章 总结与展望
4.1 工作总结
4.2 工作展望
参考文献
致谢