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黄颡鱼神经肽Y和生长抑素基因克隆、表达及与生长性状相关性研究

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摘要

第一章 前言

1 黄颡鱼的生物学特征和资源现状简介

2 鱼类生长轴相关基因研究

2.1 GH

2.2 IGFS

2.3 GHRH和PACAP

2.4 GnRH

2.5 Ghrelin和CCK

2.6 TRH、CRF和DA

2.7 Leptin和NE

2.8 NPY

2.9 Somatostatin

3 本研究的目的和意义

第二章 黄颡鱼NPY基因的克隆及其表达特征分析

1 材料与方法

1.1 实验材料

1.2 实验方法

2 结果与分析

2.1 黄颡鱼NPY基因cDNA全长克隆

2.2 黄颡鱼NPY cDNA序列分析

2.3 NPY蛋白的生物信息学分析

2.4 基于NPY氨基酸序列的同源性分析

2.5 黄颡鱼NPY基因表达特征分析

3 讨论

3.1 黄颡鱼NPY基因的保守性

3.2 黄颡鱼NPY基因表达特征分析

第三章 黄颡鱼生长抑素基因的克隆及其表达特征分析

1 材料与方法

2 结果与分析

2.1 黄颡鱼Somatostatin基因cDNA全长克隆

2.2 黄颡鱼Somatostatin cDNA序列分析

2.3 Somatostatin蛋白的生物信息学分析

2.4 基于Somatostatin氨基酸序列的同源性分析

2.5 黄颡鱼Somatostatin基因表达特征分析

3 讨论

第四章 黄颡鱼NPY基因多态性与生长性状相关性研究

1 材料与方法

1.1 实验材料

1.2 实验方法

2 结果与分析

2.1 NPY基因的多态性检测

2.2 多态片段序列分析

2.3 NPY基因的遗传多样性分析

2.4 NPY基因多态性与生长性状相关性分析

3 讨论

参考文献

致谢

附录Ⅰ

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摘要

调控鱼类生长的核心主要由垂体分泌的生长激素-肝脏内分泌类的胰岛素生长因子(Ⅰ)组成的神经内分泌生长轴(GH-IGF-(Ⅰ))调节,GH-IGF-(Ⅰ)内分泌轴的作用开始于垂体中GH的产生,而神经肽Y(neuropeptide Y,NPY)和生长抑素(Somatostatin)是GH两种主要的调控因子,NPY在鱼类体内调控鱼类的摄食,诱导GH的释放,Somatostatin则抑制GH的释放。
   黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)隶属于鲇形目(Siluriformes),鲿科(Bagridae),黄颡鱼属(Pelteobagrus Bleeker),是我国重要的淡水名优养殖品种,黄颡鱼新品种选育工作已开展多年,现阶段生长速度快是黄颡鱼选育的主要目标,通过分子标记辅助育种能够加快黄颡鱼的选育进程。NPY和Somatostatin基因作为能够调控生长激素释放的因子,通过对黄颡鱼NPY和Somatostatin基因的克隆,研究其在黄颡鱼各个组织中的表达、胚胎发育阶段的表达、仔鱼时期发育的表达,为阐明鱼类的神经内分泌生长轴提供理论依据,并将NPY基因作为与生长相关的候选功能基因筛选多态位点,对NPY的多态性与生长相关性进行分析,为黄颡鱼分子标记辅助育种奠定应用基础。本研究的主要实验结果如下:
   1.黄颡鱼神经肽Y(NPY)基因cDNA全序列的克隆及其表达特征分析
   黄颡鱼NPY基因cDNA序列全长772 bp,开放阅读框282 bp,编码93个氨基酸,其与瓦氏黄颡鱼同源性最高(97%),与斑点叉尾鮰、建鲤、胭脂鱼、中华倒刺鲃的同源性分别为87%,72%,72%和70%。NPY mRNA在胚孔闭合期开始检测到表达,到出膜期是一个表达升高的过程;黄颡鱼出膜第一天到第二十天都能检测到NPYmRNA的表达,在黄颡鱼出膜第三天到第五天NPY mRNA表达量显著高于出膜第一天(P<0.05);黄颡鱼NPY基因在黄颡鱼成体组织脑、脾脏、肝脏、鳃、性腺中都有表达,而在心脏、肌肉、胃、肾脏中不表达,在脑中的表达量极显著高于其他组织(P<0.01);随着饥饿时间的增加黄颡鱼脑组织中NPY表达量升高,重新投饵后NPY表达含量下降到正常水平。
   2.黄颡鱼生长抑素(Somatostatin)基因cDNA全序列克隆及其表达特征分析
   黄颡鱼生长抑素cDNA全长694bp,其中5'端非翻译区139bp,3'端非翻译区211bp,开放阅读框为345bp,编码114个氨基酸。氨基酸序列同源性比较和系统进化分析均表明,黄颡鱼生长抑素基因与其它鱼类生长抑素基因同源性较高。实时荧光定量PCR检测了生长抑素基因在黄颡鱼胚胎发育、胚后发育及成鱼各个组织的表达特征,生长抑素基因在受精卵时期就有表达,并持续至胚胎孵化,心跳期、出膜期其表达量显著高于受精卵时期(P<0.05);自出膜后的1-20d里,生长抑素基因在黄颡鱼中一直保持稳定的表达;在成体阶段Somatostatin基因只在脑组织中特异性表达。
   3.黄颡鱼NPY基因多态性与生长性状相关性研究
   利用PCR-SSCP技术对黄颡鱼NPY基因的cDNA序列进行了多态位点的查找,在N3引物的SSCP结果中呈现多态性,测序发现一个A→C的突变位点(616bp),结果表现出3种基因型,命名为AA、AB、BB基因型,通过不同基因型与黄颡鱼生长性状相关性的分析,在6月龄雄性群体间和整个群体间AA基因型体重显著大于AB基因型和BB基因型体重(P<0.05);12月龄的黄颡鱼雄性群体间、雌性群体间和整个群体间AA基因型体重显著大于AB基因型和BB基因型体重(P<0.05)。在雄性群体间和整个群体间AA基因型的体长显著大于AB基因型和BB基因型体长(P<0.05);在12月龄极小群体和整个群体中,AA基因型体重显著高于AB基因型和BB基因型(P<0.05)。由此可见AA基因型是黄颡鱼的生长的优势基因型,在黄颡鱼选育中,可以增加AA基因型个体。

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