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【24h】

Cdh1とCdc20タンパク質の結合を考慮した9次元細胞周期システムのロバストネス解析

机译:考虑CDH1和CDC20蛋白结合的9维细胞周期系统的鲁棒性分析

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摘要

本論文では,ロバストネス解析に基づきCase0~Case4の5つの9次元細胞周期システムのタンパク質ネットワークのロバストネスを比較した.文献9)で提案されたTysonモデルをCase0とし,最小二乗法を用いて推定されたタンパク質間のネットワークを加えたモデルをCase1~Case4の四つに分けた.Case1はCln2からCdc20_A,Case2Cdh1からCdc20_T,Case3はCdh1からCdc20_Aへのネットワークを加え,Case4ではCase1~Case3のネットワークをすべて加えた.つぎに3.2において感度解析手法に基づいて感度と周期感度を求めた.結果より,Cdh1からCdc20_TとCdh1からCdc20_Aのネットワークを加えるとCln2とTFの濃度変化に関連するパラメータk'_(13)~k''_(16)に対する感度の振幅と対応する周期感度の値が,Tysonモデルに比べ小さくなることがわかった.このことから,本稿で考慮した9次元細胞周期システムにおいて,Cdh1からCdc20のネットワークをTysonモデルに加えることによって,パラメータ変化に対するロバストネス,さらに周期の変化に対するロバストネスの両方を向上させるといえる.
机译:本文基于鲁棒性分析,将壳体0的五个9维细胞周期系统的蛋白质网络与案例4的策略进行了比较。参考文献中提出的泰森模型用作案例0,并且使用最小二乘法估计的蛋白质网络的模型被分成四个案例1到案例4。 CASE1从CLN2到CDC20_A,CASE2CDH1到CDC20_T,SIAL3从CDH1到CDC20_A添加了网络,并且CASE4将所有CASE1添加到CATE3网络。接下来,在3.2中,基于灵敏度分析方法确定灵敏度和周期性灵敏度。从结果中,将CDC20_T到CDC20_T的网络添加到CDC20_A到CDC20_A,以及与CLN2和TF的浓度变化相关的参数k'_(13)到k'_(16)的敏感度的值。发现相应的周期灵敏度值小于泰森模型。由此,可以说,在本文考虑的9维细胞周期系统中,通过将CDH1的网络添加到CDC 20到泰森模型,可以说是参数变化的鲁棒性和变化的鲁棒性在周期中得到改善。

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