臨床アウトカム情報を用いた細菌データに対するノンパラメトリックベイズトピックモデルの検討

摘要

近年，ゲノム解析技術の発展に伴う細菌叢のメタゲノム解析により，腸内細菌や口腔細菌の組成に関するデータが得られるようになった.細菌組成データの分析においては，疾患等の臨床ァゥトカムと関連する菌種を特定する統計解析が行われることが多くあるとともに，個々の細菌種を意味のあるクラスターに分類するためのクラスター分析による検討も多く行われている.細菌種をクラスターに分類する解析手法の一つとしてトピックモデル(潜在ディリクレ配分モデル(LDA))が提唱されている.