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MPVA软件设计及其在乳房炎易感性多座位聚合效应分析中的应用

摘要

目的:以奶牛隐性乳房炎为例来介绍MPVA软件在多座位聚合效应分析中的应用。主要具体介绍MPVA软件的原理、算法及操作。rn 方法:以南方某大型奶牛场634头(其中102头患乳房炎)中国荷斯坦牛为试验材料,采用PCR-SSCP、直接测序法分析CXCR1-5’端和编码区及IL8 2789/2862编码区两个基因共7个SNP位点遗传多态性,并用MPVA法分析CXCR1和IL8基因各位点突变及其基因型组合对奶牛乳房炎易感性的影响。rn 结果:MPVA分析发现CXCR1-1830,CXCR1-1768和IL82789/2862三位点交互作用对奶牛乳房炎易感性达到显著水平。rn 结论:CXCR1-1830,CXCR1-1768和IL8 2789/2862三位点交互模型作为奶牛乳房炎易感性相关的基因联合选择模型最佳,MPVA可用于奶牛乳房炎易感性多基因分析模型。

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