基于流式细胞术的赤芝基因组大小估测

摘要

目的：估测赤芝基因组大小。方法：以药典规定的灵芝正品来源赤芝Ganoderma lucidum作为研究对象,利用已完成全基因组测序的黑曲霉Aspergillus niger作为内标,通过机械破碎菌丝体的方法获得合适浓度的细胞核悬液,碘化丙啶荧光染色后成功应用流式细胞术进行基因组大小估测。结果：经过优化材料培养、样品制备、上机分析等实验条件,估测得出赤芝基因组大小48.98±0.60Mb,为赤芝基因组学研究提供重要数据。结论：该方法简捷稳定,在蕈菌范围内,赤芝基因组大小估测值首次得到其全基因组测序数据与光学图谱结果验证,为蕈菌基因组学研究提供重要技术平台。