miR-200家族在足细胞病中的表达及生物信息学分析

摘要

目的：检测miR-141、miR-200a和miR-200b在儿童足细胞病包括局灶节段性肾小球硬化(FSGS)及微小病变性肾病(MCD)患者血清中的含量,与临床检验结果之间的关系,并对三种miRNAs的靶基因进行生物信息学分析,为深入探索miR-141、miR-200a和miR-200b的调控机制及生物学功能奠定基础.方法：60例经肾活检及临床确诊为FSGS(30例)、MCD(30例)的患者进入本研究,选取年龄、性别相匹配的20例正常对照,共三组.用实时荧光定量PCR检测各组的三种miRNAs的含量.用TargetScan与PicTar两种计算方法预测三种miRNAs靶基因取交集后与己证实的靶基因整合进行信号通路富集分析、建立miRNA-gene调控网络.结果：FSGS患者血清miR-141、miR-200a和miR-200b表达水平明显高于MCD组及正常对照组,同时miR-141与尿蛋白水平呈正相关,miR-141、miR-200a和miR-200b预测靶基因有216个,靶基因信号通路显著富集于Wnt信号通路、轴突导向、紧密连接、细胞周期、卵母细胞减数分裂、慢性髓细胞性白血病、黏着连接(p＜/span＞＜0.05),将42个基因与对应的miRNA建立miRNA-gene调控网络.结论：FSGS患者血清miR-141、miR-200a、miR-200b表达显著上调,有望作为FSGS诊断的生物标记物,并为肾脏纤维化发病机制上的研究提供了新的研究思路.