烟草根际和叶围中与烟碱生物降解有关细菌群落的发生和变化

摘要

为了更进一步的了解细菌群落的功能,用烟碱作为菌的唯一碳源,在烟草根际和叶围中分离了96个烟碱降解菌(ND),其中56个来源于根际,40个来源于叶围,并对其进行系统性的量化分析.19个叶围菌株(47.5％)和39个根际菌株(69.6％)的ND效率超过了90％.16S rRNA基因序列显示了细菌亲缘关系群落组成的高度异质性和生存微环境的特异性.叶围的ND细菌群落有10个假单孢杆菌优势种群属,而根际ND有6个节细菌属.首次报道的ND属有马西利亚,欧文氏菌,短波单胞菌和类芽孢杆菌属.从得到ND细菌库的数据中,多样性指数表明了叶围中的烟碱细菌群物种丰富度、多样性、优势度比根际周围高,而根际中的ND细菌平均指数比叶围中高.代谢中间产物的检测表明了ND在四个代谢途径中产生了假单孢杆菌,而节细菌属的产生只在吡啶途径中出现.该研究结果让我们更进一步的了解ND细菌的多样性、微生物环境多样性、新的ND生物资源.