柑橘黄化脉明病毒柠檬分离物的全基因组序列测定

摘要

本文以柠檬为研究对象，指出柑橘黄化脉明病毒(citrus yellow vein clearing virus，CYVCV)主要为害柠檬和酸橙，造成叶片侧脉脉明及侧脉附近黄化，并有反卷、皱缩等症状，在柠檬上该病毒诱导产生明显的明脉和叶片畸形，偶尔产生环斑和脉间坏死，在来自湖北、湖南和四川的柠檬样品上检测到CYVCV，在柠檬植株上表现该病毒病的典型症状。根据已报道的该病毒序列设计引物对一株柠檬植株所携带的CYVCV（命名为CYVCV-LMC）进行了全基因组序列测定。CYVCV-LMC基因组大小为7539个核苷酸(nt)，具有6个部分重叠的开放阅读框(ORF1—ORF6)，ORFl(79—5028)为4950nt，编码分子量为186kDa的与病毒复制相关的蛋白；ORF2、ORF3和ORF4组成一个与病毒复制相关三基因盒(TGB)，大小分别为678nt、327nt和183nt，ORF4编码分子量约6.4kDa的假定蛋白；ORF5(6148—7125)为978nt，编码分子量约为34kDa的外壳蛋白(CP)；ORF6(6825-7493)为669nt，编码分子量约为23kDa的+ssRNA结合蛋白。其5′末端非翻译区为79nt，3，末端非翻译区为36nt。序列比对结果表明，CYVCV-LMC与GeneBank登录的CYVCVY1分离物全基因组核苷酸序列的相似性为97%，各ORF的核苷酸序列相似性为960/0—980/0。