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浙江省猪戊型肝炎病毒感染状况及其分子流行病学研究

摘要

本研究利用实验室所建立的ELISA方法对2005-2008年采集的1245份猪血清进行猪戊型肝炎病毒(HEV)特异性抗体的检测。结果表明共有652份血清检测为猪HEV抗体阳性,平均阳性率为52.3%。其中2005年与2006年浙江省不同地区猪群HEV抗体阳性率分别为62.7%(175/279)和61.4%(301/490),明显高于2007年的43.096(59/137)和2008年上半年的35.1%(87/248)。从猪场水平来看,仅有3个猪场未检测到HEV抗体,场阳性率93.296,提示我省猪场中HEV感染相当普遍。荧光定量PCR检测结果显示对不同地区猪场中HEV RNA检出率为35.896(53/148),说明HEV已经在浙江地区的猪群中广泛、快速传播。序列分析表明浙江省猪源HEV毒株之间的核苷酸同源性在75.5%-96.3%,不同毒株之间存在较多的位点突变。其中毒株PJ-1与已知国内流行的基因IV型HEV毒株同源性仅为77%左右(表3),而与基因III型HEV毒株具有较高的同源性(88%)。其余9株猪HEV均与基因IV型毒株具有很高的同源性,有的甚至可达99%。而人源HEV毒株human-1与除PJ-1外的9株猪源HEV核苷酸同源性较高(83.4%-89.5%)。进一步对猪HEV ORF2序列进行遗传进化分析,发现这9株猪HEV浙江毒株与大部分国内及日本猪源或人源HEV毒株同属于基因IV型,它们之间从分离的地理位置未表现出明显差异,亲缘性非常近;而毒株PJ-1则处于基因III型分支中,与核苷酸比对结果一致,表明PJ-1株为目前国内少见的III型HEV毒株。但浙江省内还是以基因IV型毒株的流行为主。人源HEV毒株Human-1也同处于IV型分支中,且遗传进化分析显示浙江省内猪HEV毒株与人源HEV在遗传关系上具有很高的亲缘性。

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