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由大规模基因芯片表达谱数据构建基因调控亚网络的方法

摘要

本发明公开了一种由大规模基因芯片表达谱数据构建基因调控亚网络的方法。包括如下步骤:1)基因芯片表达谱缺失数据值估计;2)利用贝叶斯网络构建基因间的调控网络;3)对原始的表达数据重新抽样,重复步骤2),得到一个可能的贝叶斯网络的集合;4)统计分析网络特征,重构显著性的亚网络模块。本发明实现从大规模基因芯片实验数据中获取多个基因间调控关系,这个结果是传统生物学实验无法得到的;它在一定程度上弥补了芯片数据不足而导致贝页斯网络学习噪音比较大的缺点。通过构建小的亚网络,在一定程度上来说,紧密调控基因之间的关系可以通过一致图的方法来对那些不是直接调控的基因间关系去噪。得到的亚网络为下步的生物学实验提供更好指导。

著录项

  • 公开/公告号CN101105841B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2011-06-15

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 浙江大学;

    申请/专利号CN200710067316.2

  • 发明设计人 陈铭;陈晓辉;宁开达;

    申请日2007-02-12

  • 分类号

  • 代理机构杭州求是专利事务所有限公司;

  • 代理人张法高

  • 地址 310027 浙江省杭州市浙大路38号

  • 入库时间 2022-08-23 09:07:09

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2014-04-09

    未缴年费专利权终止 IPC(主分类):G06N 3/12 授权公告日:20110615 终止日期:20130212 申请日:20070212

    专利权的终止

  • 2011-06-15

    授权

    授权

  • 2008-03-05

    实质审查的生效

    实质审查的生效

  • 2008-01-16

    公开

    公开

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