人体菌群16S rDNA高通量测序物种精确鉴定的优化方法

摘要

本发明公开了一种人体菌群16S rDNA高通量测序物种精确鉴定的优化方法，包括以下步骤：1)、建立基于人体微生物样品的人体宏基因组菌基因组数据库；2)、提取人体宏基因组菌基因组数据库的全长16S rDNA序列，建立不同人体部位的16S rDNA物种注释数据库；3)、建立样本‑菌种16S序列丰度相关性网络，并利用该数据训练机器学习模型。本发明还同时提供了利用构建所得的数据库和模型，对高通量测序16S rDNA序列进行物种鉴定和丰度计算的方法。本发明能大大提高16S rDNA的物种分类分辨率和准确度，使分析者能够根据结果找到更加准确和明确的菌种。