一种基于宏基因组学的病原微生物检测方法及装置

摘要

本发明公开了一种基于宏基因组学的病原微生物检测方法及装置，包括：获取待检测样本的宏基因组测序数据；对宏基因组测序数据进行预处理，得到目标数据；对目标数据进行筛选，得到目标序列；对目标序列进行聚类分析，获得待测样本的候选物种类别；将目标数据与非冗余参考基因集进行比对，并计算每个基因在单个样本中的丰度，得到待测样本的目标物种分类信息；将目标数据与病原微生物可检测数据库中的信息进行比对，获得待测样本的耐药基因和毒性元件信息；将目标物种分类信息、耐药基因和毒性元件信息，确定为待检测样本的检测结果。本发明提升了病原微生物检测适用性范围和病原检测准确性。