一种多域蛋白质Linker构建方法

摘要

一种多域蛋白质Linker构建方法，首先，根据未封闭的残基之间的C_α原子距离确定需要构建的Linker氨基酸序列长度；然后，通过随机游走的方式确定Linker中所有C_α原子的坐标，并通过原子冲突和封闭性检验判断所生成的C_α原子的有效性；其次，利用Pulchra方法生成其它原子，并利用蒙特卡罗算法对整个结构进行调整，同时根据二面角、原子冲突和键角等能量指导算法进行搜索；最后，根据蛋白质结构精修工具对最终结果进行精修，从而得到Linker的结构。本发明提供一种预测精度和效率均较高的多域蛋白质Linker构建方法。